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尽管越来越难以开发出新的抗生素菌株 但科学家们在神经网络的帮助下做到了这一点

该药物被命名为halicin,是Arthur C. Clarke的Space Odyssey中虚构的AI机器人HAL 9000的帽子提示,它是经过培训的软件在6000多种复杂化合物的数据库中被选为可能的抗生素。一个药理小组在实验室中适当地合成了盐霉素,发现它能够杀死皮氏培养皿中的多种细菌。

有希望的是,halicin还能够治愈感染了鲍曼不动杆菌特定菌株的小鼠,鲍曼不动杆菌是一种常见的侵袭性病原体,通常在医院中传播,对所有先前已知的抗生素都有抗药性。在星期四在Cell上发表的[PDF]论文中描述了这种新型抗生素。

事实证明,随着资金枯竭,制药公司破产,细菌不断滋生,新抗生素的开发存在问题。医生和农民不计后果地发放抗生素剂量,也使细菌能够适应,使它们更难以杀死。

詹姆斯·柯林斯(James Collins)表示:“我们正面临着越来越多的关于抗生素耐药性的危机,这种情况是由于越来越多的病原体对现有抗生素产生了耐药性,以及生物技术和制药行业对新型抗生素的贫血管道造成的,”美国麻省理工学院医学工程和科学的Termeer教授。

柯林斯和他的同事认为,神经网络可以帮助制药业查明新型抗生素的功能,这种新型抗生素的功能不同于以前的药物,不仅可以击败细菌,而且使他们更难产生耐药性。

首先,棺材在2335种化合物的数据集上训练了一个深层神经网络,该数据集来自FDA批准的植物,动物和微生物中的药物和化学物质清单。该二元分类器被教导根据其化学结构预测化合物阻止大肠杆菌传播的可能性,大肠杆菌是一种常见的可引起食物中毒的细菌。

接下来,针对包含另一组6,111种化合物的第二个数据集测试了该模型。该算法突出显示了99种最有可能对大肠杆菌有效的药物。当研究小组研究该选择时,他们将该族减少到51个。只有这些化合物中的两种显示出被证明可抑制大肠杆菌生长的特性。进一步的检查显示,一种药物的毒性可能比另一种药物低,研究人员最终选择了halicin。

这种药物被描述为“与传统抗生素在结构上有所不同”。它设法破坏了多种不同病原体菌株的样品,包括大肠杆菌,结核分枝杆菌,肠杆菌科(CRE),鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌。

鸡蛋头在论文中写道:“世界卫生组织认为这些病原体是最迫切需要新疗法的细菌。”

Halicin成功地根除了结核分枝杆菌,这种细菌可导致结核病,并能够阻止CRE的生长。它也能够治疗感染鲍曼不动杆菌的小鼠。但是无法解决铜绿假单胞菌(一种对抗生素具有高度耐受性的肺部病原体)。

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